Pour atteindre ses objectifs et développer ses activités, le FMDV noue des partenariats techniques et financiers avec un grand nombre d'acteurs : villes et régions et leurs réseaux thématiques ou nationaux, ministères, institutions de financement, bailleurs de fonds, agences onusiennes, entreprises privés, universités ou instituts de recherches. Ces partenariats peuvent se tisser dans le long terme ou sur la réalisation d'actions spécifiques.