Le FMDV est gouverné par une Assemblée Générale réunissant l'ensemble des membres de l'organisation et par un Conseil d'Administration, instance dirigeante du FMDV, composé de villes et régions membres du FMDV présidé par 2 Co-Présidents et au moins 6 Vice Présidents, un conseil scientifique de 5 Experts Internationaux et Membres Honoraires, 1 Trésorier et le Directeur Exécutif.